Федотов А. А. Государственно-конфессиональные отношения в России. Учебное пособие. М.-Архангельск, 2009. 224 с.
Федотов А. А. Русская Православная Церковь в 1943-2000 гг.: внутрицерковная жизнь, взаимоотношения с государством и обществом (по материалам Центральной России). Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора исторических наук. Иваново, 2009. 48 с.
Федотов А. А. Русская Православная Церковь в 1943-2000 гг.: внутрицерковная жизнь, взаимоотношения с государством и обществом (по материалам Центральной России). Иваново, 2009. 402 с.
Федотов А. А. Собор. Историческая повесть. Иваново, 2009. 88 с.
Федотов А. А. Свет, тьма и тень. Историческая повесть. Иваново, 2010. 80 с.
Федотов А. А. Свет во тьме. Исторические повести. Иваново, 2010. 254 с.
Русская Православная Церковь в ХХ веке на Ивановской земле. Сборник документов и материалов / Автор-сост. А. А. Федотов. Иваново, 2010. 340 с.
Федотов А. А. Русская Православная Церковь в 1943-2000 гг.: внутрицерковная жизнь, взаимоотношения с государством и обществом (по материалам Центральной России. Статьи. Русская Православная Церковь в ХХ веке на Ивановской земле. Документы и материалы. Церковно-исторический сборник. Иваново, 2011. 1000 с.
Федотов А. А. Формирование учения об империализме в начале ХХ века. Учебное пособие. Архангельск-Иваново, 2011. 106 с.
Федотов А. А. Христианские праздники. Вероучение. Богослужение. Сборник статей. Иваново, 2011. 100 с.
Федотов А. А. Разные рассказы. Иваново, 2011. 114 с.
Федотов А. А. У истоков системы. Повесть. Иваново, 2012. 102 с.
Федотов А. А. Строчки синодика. Памяти ушедших в путь всей земли. Иваново, 2012. 60 с.
Федотов А. А. Наследники Ост-Индской компании. Роман. Иваново, 2012. 225 с.
Федотов А. А. Призрачная Америка. Иваново, 2012. 190 с.
Черный карликовый тигр. Повесть-сказка на русском и английском языках (переводчик М. В. Баламакова). М., 2012.
